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1％も読み取れなかった博物館のカメDNA断片、ガラパゴス絶滅系統2つを再び探した
研究者がガラパゴス巨大亀の古い博物館の骨5点で残ったDNA断片を分析し、サンクリストバルとサンタフェ島の絶滅系統2つを系統樹に戻した。一部の標本では全ゲノムの1％未満しか読み取れませんでしたが、複数の計算手法を組み合わせて関係を推定しました。
絶滅したカメを複製したり、生きている新しい種を発見したという意味ではありません。非常に少ない遺伝情報を基準系統樹に合わせた結果であり、生きている雑種カメにその遺伝型が残ったのか、保全繁殖に使うことができるかは別に確認する必要があります。
なぜ博物館の骨のDNAは読みにくいのですか？
熱帯環境と長い保存時間は、DNAを短い断片に割り込み、周囲の微生物とヒトDNAを混ぜることを可能にします。通常、分析は空白が多すぎるサンプルを捨てます。今回の研究は、いくつかの誘電体推定ツールを組み合わせて、少ない彫刻も生きているカメと歴史標本の高品質系統樹の上で比較しました。
どのサンプルを確認しましたか
研究チームは絶滅した系統2つに属する歴史標本5点の乾いた骨を書きました。新しい計算は、サンクリストバルの古い洞窟標本とサンタフェ標本がそれぞれ異なる絶滅系統であることを裏付けた。サンクリストバル系統は、2022年のミトコンドリアDNA研究でも現在個体群と異なると報告されています。
1％未満でどのように区別しましたか
1つのサンプルから完全な誘電体を新しく作ったわけではありません。読まれた場所ごとに可能な遺伝型の確率を計算し、すでに品質の良いいくつかのカメ誘電体で作られた基準木に最も一貫して置かれる場所を見つけました。情報が少ないほど誤差が大きくなるため、複数の方法が同じ関係を支持するかどうかを対照しました。
保全にすぐに何ができますか
過去の船員は亀を島の間に移し、一部は他の系統と繁殖しました。そのため、絶滅系統の遺伝彫刻が生きている雑種に残った可能性があります。しかし、今回の研究だけで対象物を選んだり、繁殖計画が確定したわけではありません。実際のオブジェクトのより細かい誘電体検査が最初です。
次の確認は何ですか
極低密度DNA法が他のサンプルや種でも同じ関係を再現するかどうかをテストする必要があります。系統という単位が法的種分類とまったく同じではありません。保全機関は生きている個体の血統、健康、遺伝多様性を一緒にサルピン後繁殖するかどうかを決定しなければなりません。