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Fragmento de ADN de tortuga de museo que no fue leído ni siquiera en un 1%, redescubiertos dos linajes extintos de Galápagos
Los investigadores analizaron los fragmentos de ADN restantes de cinco antiguos huesos de museo de tortugas gigantes de Galápagos, volviendo a colocar dos linajes extintos de las islas San Cristóbal y Santa Fe en el árbol filogenético. Aunque en algunas muestras se leyó menos del 1% de todo su genoma, combinamos varios métodos computacionales para estimar las relaciones.
Esto no significa que hayamos clonado una tortuga extinta o descubierto una nueva especie viva. Este es el resultado de comparar muy poca información genética con el árbol filogenético estándar, y debe confirmarse por separado si el genotipo permanece en las tortugas híbridas vivas y si pueden usarse para la reproducción de conservación.
¿Por qué era difícil leer el ADN de los huesos de los museos?
Los ambientes tropicales y los largos tiempos de almacenamiento rompen el ADN en fragmentos más cortos y hacen que el ADN humano se mezcle con los microorganismos circundantes. Normalmente, los análisis descartan muestras con demasiados blancos. Este estudio combinó varias herramientas de estimación del genoma y comparó pequeños fragmentos de árboles filogenéticos de alta calidad de tortugas vivas y especímenes históricos.
¿Qué especímenes fueron identificados?
El equipo de investigación utilizó huesos secos de cinco especímenes históricos pertenecientes a dos linajes extintos. Los nuevos cálculos respaldan que las antiguas muestras de las cuevas de San Cristóbal y las muestras de Santa Fe pertenecen a diferentes linajes extintos. También se informó que el linaje de San Cristóbal era diferente de la población actual en un estudio de ADN mitocondrial de 2022.
¿Cómo lo clasificaste como menos del 1%?
No se creó un genoma completo a partir de una sola muestra. Para cada posición leída, calculamos la probabilidad de un posible genotipo y encontramos la posición que correspondía de manera más consistente a un árbol de referencia creado a partir de varios genomas de tortuga que ya eran de alta calidad. Debido a que menos información significa errores mayores, contrastamos los métodos para ver si apoyaban la misma relación.
¿Qué puedes hacer ahora para ayudar a preservarlo?
En el pasado, los marineros transportaban tortugas entre islas y algunas se reproducían con otras cepas. Por tanto, es posible que fragmentos genéticos del linaje extinto permanecieran en los híbridos vivos. Sin embargo, este estudio por sí solo no seleccionó a los individuos objetivo ni confirmó el plan de reproducción. Lo primero es realizar pruebas genómicas más detalladas de individuos reales.
¿Cuál es la próxima confirmación?
Queda por comprobar si los métodos de ADN de densidad ultrabaja reproducen las mismas relaciones en otras muestras y especies. Tampoco es exactamente lo mismo la unidad denominada linaje que una clasificación legal de especies. Las organizaciones conservacionistas deben examinar el pedigrí, la salud y la diversidad genética de los individuos vivos antes de decidir si los reproducen.